A Seção de Protótipos, subordinada à Diretoria da Faculdade, tem por objetivo atender a toda a comunidade, dando suporte à construção de protótipos e à execução de experimentos que auxiliem ou sejam necessários para realização de ensaios de campo ou laboratório.
A Seção dispõe de recursos para execução de projetos construtivos na linha de metal-mecânica com recursos de usinagem, caldeiraria e acabamento, com estrutura capaz de atender a todas as áreas da Faculdade de acordo com a demanda de docentes nas atividades de graduação, pós-graduação e pesquisa.
Oferece suporte às aulas práticas das disciplinas de graduação e de pós-graduação de modo a possibilitar que os alunos tenham contato com peças e equipamentos e sua montagem e desmontagem, além de oferecer importante apoio aos projetos de pesquisas de todas as áreas relacionadas à engenharia agrícola, construindo os protótipos e auxiliando na execução de alguns experimentos que envolvem o ensaio de dispositivos mecânicos.